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扩展空间生物学的无限可能 | 亚博生物 FFPE 空间转录组解决方案!
发布时间:2021-04-29 浏览次数:179
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FFPE 处理是目前长期保存病理样本的标准化方法,保存了大量的临床上患病和正常组织的样本资源,该样本代表了珍贵且来源广泛的生物医学研究材料,据统计世界上大约有数十亿份组织样品保存在医院或者组织样品库中,其中绝大多数是 FFPE 样品。但是由于 FFPE 样本通常珍贵且保存时间长,存在 RNA/DNA 量少和高度降解的问题,因此如何获得 FFPE 样本所蕴藏的生物信息,如何利用分子生物学方法对 FFPE 样本进行检测,进而针对 FFPE 样本进行高通量组学分析就变得越重要。针对目前热度很高的空间转录组学,如何实现对 FFPE 样本的检测显得尤为迫切。


10X Genomics 旗下全新的 Visium FFPE 空间基因表达解决方案,打破过去从 FFPE 组织中获取空间全转录组基因表达信息的壁垒 空间转录组:Visium Spatial Gene Expression 技术不在局限于冰冻组织切片,10XGenomics 通过不懈的研发整合,已推出 Visium FFPE 空间基因表达解决方案,亚博生物成为中国首批引进该技术方案的高新技术企业之一。通过优化后空间 Visium FFPE 全转录组方案,能够从 FFPE 样本中以高灵敏度和高特异性分析相关基因的表达,在形态学背景下实现真正的探索发现。


Visium FFPE 的原理示意

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Visium FFPE 的产品特色

(1)使用已存档的生物库样本进行生物标记物挖掘;

(2)进行回顾性研究和纵向研究,以追踪特定时间内的生物学过程;

(3)通过结合免疫荧光技术,同时进行蛋白和基因表达可视化检测;

(4)与 H & E 技术结合进行形态学分析,充分挖掘珍贵的组织样本中的信息;


关于 Visium FFPE

Visium FFPE 组织样本的可视化空间基因表达是一种突破性的解决方案,它将 FFPE 组织样本的组织学优势与高通量的 sc-RNA-seq 相结合,为传统的病理学分析提供了详实的补充。该技术可对人类和小鼠 FFPE 样本中超过 18,000 个基因的 RNA 表达进行高分辨率的空间分析。通过全转录组分析(WTA)和 FFPE 组织图谱分析,您可以检测任何通路中的任何基因,解决组织细胞类群组成的异质性,并获得这些信息在组织样本中的空间信息。

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Visium FFPE 的可视化空间基因表达在完整的 FFPE 组织切片上获取基因表达信息,可以更深入的了解组织的生理生化特征:包括生物标志物的发现,对保存的样本进行回顾性和纵向研究,以及对正常和病变组织的比较研究。

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FFPE 组织的可视化空间基因表达具有高敏感性、特异性和可重复性

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Visium FFPE 对保存的 FFPE 组织样本进行了全组织覆盖的转录组分析

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应用示例:Visium FFPE 空间技术 呈现 三阳性导管癌原位样本的肿瘤微环境

亚博生物目前已经开通 10x Visium FFPE 产品预定,想要尽早抢鲜体验该产品的老师们,请尽快同驻地销售联系吧。


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