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Rip-seq

技术简介

RNA- 蛋白质相互作用在调节 mRNA 和非编码 RNA 功能中的相关性越受到重视,RNA 免疫沉淀(RIP)是研究体内单个蛋白质与 RNA 分子之间物理联系的有力方法。RIP 基于使用针对目标蛋白的特异性抗体来拉下 RNA 结合蛋白(RBP)和靶标 RNA 复合物,与该蛋白质复合物的所有 RNA 将被分离出来,并可以通过二代测序进行进一步分析。

技术原理

运用针对目标蛋白的抗体把相应的 RNA- 蛋白复合物沉淀下来,然后经过分离纯化对结合在复合物上的 RNA 进行测序分析。

亚博优势

样本处理:丰富的样本处理经验,应对不同研究目的解决方案;

文库构建:小片段、微量 RNA 建库经验;

数据分析:针对 peak 查找、注释的权威算法;全面的分析内容;灵活的定制分析;

服务流程

对 IP 得到的 RNA 质检纯化——rRNA 去除(可选)——文库构建——测序——数据分析。

样本要求

免疫共沉淀总 RNA 量 >30ng/ 样本;

推荐测序数据量 >6G/ 样本。

数据分析

Rip-seq 数据分析流程图

Rip-seq 数据分析项目图

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