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lncRNA 和 mRNA 共表达分析

Demo 结果

lncRNA 和 mRNA 共表达分析

通过关键 lncRNA 的共表达 mRNA 预测出其功能

Demo 结果解读

网络图为筛选出的核心基因之间的关系,通过图论的方法计算出关键 lncRNA 与 mRNA,并通过关键 lncRNA 的共表达 mRNA 预测出其功能。

lncRNA 和 mRNA 共表达分析介绍

共表达网络图(Coexpression Network)是根据基因表达信号值的动态变化,计算基因间的共表达关系,得到基因间的表达调控关系及调控方向,从而构建基因的表达调控网络。通过研究 lncRNA 与 mRNA 的共表达关系,研究者可通过分析 lncRNA 调控能力,获得样本随实验变化的核心调控 lncRNA。

分析要求

每组数据 3 个或 3 个以上生物学重复,每个样本均含有 lncRNA 与 mRNA 数据,差异基因或者关注的部分基因。

提供结果

图片文件(Network 图),包括 png,PDF 格式;

Cytocape 文件:可以 cytoscape 打开进行细节调整;

文本文件:基因之间共表达相关性以及显著性,lncRNA,mRNA 核心共表达的排序。

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